在第二季中，那须田步（冈田 饰）和九鬼静（中井 饰）这对搭档，在“工作方式改革”的浪潮席卷下，降临到了越来越混乱的日本医疗界。除了医生的短缺，医生和护士的加班时间也受到很大的限制，在不断缩小的生命现场，挑战新的战斗。

步和静这次受雇于长期担任地区医疗核心的主干医院“西东京综合医院”。该院前院长的腐败被发现后，标榜“正确的医疗，正确的工作方式”的“干净年轻的有领袖魅力的新院长”，着手以工作方式改革为中心的组织变革，不断推进任务共享、勤务管理的彻底、医疗的可视化。但是这位新院长就是“本季最大的敌人”。不久，步&静与新院长对立起来。                         

第1集

2022年，在纽约的一家医院里，身患绝症的超级护士九鬼静（中井贵一）成功做了手术，之后便与那须田步（冈田将生）留在当地工作。自那以后过了两年，回到日本的那须田步前往他新的工作地点，西东京综合医院。在途中发生了一件事。

那须田步在路过一家饭团店时，突然有一位态度蛮横的客人，大田黑胜一（内藤刚志）吐出了血痰并倒下。那须田步立刻进行了应急处理，将大田黑送往西东京综合医院。然而，恢复意识的大田黑依然态度蛮横的要求道“把我送到特别病房！”，这让神山直彦（风间俊介）等外科医生们感到为难。

因为实际上大田黑直到上个月为止还是该医院的院长。由于渎职和受贿行为接连曝光，他被迫辞职。根据医院的合规管理原则，无法对这样的人进行特殊对待——致力于推行干净的组织改革的年轻有魅力的新院长药师丸卓（山崎育三郎），将大田黑安排到了离岛的分院。大田黑虽然愤怒并明确表示了抵抗，但最终还是被赶出了医院。

另一方面，那须田步偶然与九鬼静实现了两年来的再次重逢。然而，就在此时，前往分院的大田黑再次倒下……！