在静谧的生活中,俵家似乎已远离了忍者的世界,然而,过去的阴影始终如鬼魅般徘徊不去。当BNM(忍者管理局)再次找上门来,俵家再次被卷入一场未知的风波。
过去的俵家,曾为了解救被绑架的政治家向井瞳子,与风魔忍者激战。晴在与风魔忍者的对决中,虽然取得了胜利,但在对方求饶时却未能下手致命一击。这一决定,间接导致了长子岳的死亡,让他成为了蒙面忍者的牺牲品,尸体沉入冰冷的海中。这一事件,让俵家决定从忍者的世界隐退,过上普通人的生活。
然而,生活并未如俵家所愿那般平静。父亲壮一虽然表面上专注于自家酿酒事业,但财务状况却并不顺利。母亲阳子对平淡无味的家庭生活感到厌倦,反复在超市进行扒窃。凪则被京谷告白,但她却拒绝了,反而对偷走艺术品后再归还的行为产生了浓厚的兴趣。而晴,则在从事自动贩卖机的补给工作的同时,每天夜晚都会去他常去的牛丼店,那里有一个名叫伊藤可怜的女性,成为了他生活中的一大乐趣。
然而,当BNM的浜岛再次找上门来,请求壮一调查最近发生的游览船上所有乘客死于毒物的事件时,俵家再次被卷入风波。壮一拒绝了这一请求,表示“不再让家人陷入危险之中”。但事情并未因此结束,可怜的真实身份被揭示为一名记者,而她的行为也引起了晴的注意。
晴原本与可怜有约,但约定的晚餐被取消后,晴决定跟踪可怜。他发现了可怜戴上面具前往俱乐部与一个叫秋山的男子会面,收集关于游览船事件的情报。从他们的对话中,晴得知有一名乘客在该事件中幸存,并被怀疑为凶手。然而,当秋山提到“黄色的花…”时,他被刺客杀害。刺客随后试图袭击可怜,但晴及时出现,与刺客展开激战。
在激烈的战斗中,刺客受了伤逃到了外面。就在晴追出去的时候,刺客被一辆车撞死。然而,晴发现死者并没有他留下的手臂伤痕,证明这是一个替身,真正的刺客已经逃脱。此时,新兴宗教元天会的教主辻冈也在附近的俱乐部附近出现,这一切似乎都与他有着千丝万缕的联系。
另一方面,凪在偷拍艺术品照片后,将其发布到了社交媒体上。突然,有一个陌生人关注了她,并询问她“你自称忍者?”。这个神秘人的出现,让俵家的生活再次陷入了混乱。