徐理事在校园内推行了一系列严苛措施,不仅废除了奖学金制度,还将学费上调了50%,导致众多学生面临辍学危机。秀雅挺身而出,前往炳文集团揭露徐理事的恶行,理事团为此决定依据财团规定,以四分之三学生及教师的同意为条件,解雇徐理事。
与此同时,警方对海成发出了全国通缉令。为了保护身边的人不受徐理事的伤害,海成决定亲自出马,将徐理事绳之以法。而关键证据——金院长指控徐理事杀人的录音,就藏在金院长的家中。于是,众人决定冒险一试,潜入金家寻找证据。
秀雅回到炳文高中,张贴大字报强烈谴责徐理事的所作所为,并要求他撤回不合理政策。徐理事为了平息事态,提出撤销政策,但条件是秀雅必须离职。这段对话被宥贞无意间听到。为了安抚师生情绪,徐理事召开了临时大会,承诺将杜绝成绩造假等丑闻,并取消新政策。然而,宥贞却在此时揭露了秀雅为保护学生而被迫离职的真相,引发了学生们的强烈不满,他们高呼“徐明珠下台”。
经过一番波折,海成终于拿到了徐理事犯罪的USB证据,前往警局洗清了自己的嫌疑。警方也随即对徐明珠和校长展开了拘捕行动。得知消息后,徐明珠让校长先带艺娜离开,并启动了火灾警报器,企图用汽油和打火机放火烧毁学校。海成及时赶到,交出手枪并劝说徐明珠释放无辜的学生。艺娜在离开后也返回学校,与海成一同恳求徐明珠停止伤害他人。面对大势已去,徐明珠试图自杀,但被秀雅及时抢下手枪。海成接住了掉落的打火机,化解了危机。师生们为此鼓掌欢呼。
在法院公开审理徐明珠的案件中,校长全盘揭露了他的罪行,徐明珠最终被判处无期徒刑。艺娜前来探望他,表达了自己对徐明珠行为的不解和依然存在的爱。海成回到炳文高中看望大家,虽然大家一开始故意冷淡,但在他离开时,同学们纷纷从窗边扔出写满感谢话语的纸飞机。整个校园的天空充满了飞翔的纸飞机,场面温馨而感人。
海成在整理家中阁楼时,意外发现了一块贴着星星贴纸的空心地板。撬开木板后,他发现了大批黄金。他立即联系安锡浩报告任务完成。五年后,李东民发表了小说《卧底高中》,秀雅成为了正式教师,安宥贞加入了国情院,艺娜则专注于自己的兴趣,安锡浩升任国情院院长,第4组组员英勋与美贞坠入爱河,而海成与秀雅也终成眷属。