1863年,京都——。在老好人父亲七也经营的小茶馆里工作的深草丘十郎谨小慎微地过着每一天。然而,一天夜里,这种平静的日常生活发生了翻天覆地的变化。
七也藏住了逃进店里的佐幕派藩士,被长州藩士庄内玄悟砍死。气得浑身发抖的丘十郎为了追赶庄内等人冲出了店铺,这时出现了一个男人,他似乎领会了丘十郎的意思,将一名藩士斩杀了。他自称壬生浪士组局长近藤勇,对丘十郎说了一句“感谢父亲的勇气”就离开了。
丘十郎发誓要向逃跑的庄内复仇,决定加入壬生浪士组。根据队士招募的告示进入了入队考试的会场,不过,聚集了以涩皮喜平为首,全都是对技术有印象的实力者,连拿刀都不稳的丘十郎面对比赛也完全不服气。
尽管如此丘十郎还是不愿放弃入伍,在冲田总司的指示下,与应征者中出类拔萃的剑之达人镰切大作对战。